В ИНС осуществляется сетевое сотрудничество в рамках сетевого объединения высших учебных заведений «Педагогические кадры России» /main/structure/others/umo/pkr/1360306978/1360308568/

Партнерами ИНС выступают:

• ГОУ ВПО «Петрозаводский государственный университет»
• Северо-Восточный федеральный университет им. М.К. Аммосова
• Институт гуманитарных исследований и проблем малочисленных народов Севера СО РАН
• ФГНО «Научно-исследовательский институт национальных школ Республики Саха (Якутия)
• Многопрофильные колледжи Ямала, Таймыра, Ненецкого автономного округа и др.
• Общеобразовательные средние и средне-специальные заведения (школы, гимназии) (ЯНАО, ХМАО, ЧАО, Республики Саха (Якутия), Иркутской области, Таймырского (Долгано-Ненецкого) муниципального района Красноярского края, Республики Коми, Сахалинской и Тюменской областей, Камчатского края)
• Региональные музеи и музейные центры
• Российский этнографический музей
• Музей антропологии и этнограии им. Петра Великого (Кунтскамера)
• Музей Арктики и Антарктики
• Санкт-Петербургский Дом национальностей
• Региональные представительства в г. Санкт-Петербурге (Постоянное предcтавительство Республики Саха Якутия, Представительство Ямало-Ненецкого автономного округа, Представительство Республики Коми и др.)
• Ассоциация коренных малочисленных народов Севера, Сибири и Дальнего Востока РФ

Плодотворно развивается международное сотрудничество ИНС. Институт является:

• членом международной Ассоциации ВЕВО («За будущее оленеводческого промысла»)
• партнером Международного центра оленеводства при Университете Арктики
• полноправным членом Университета Арктики

Основные формы работы международного сотрудничества:

• Обмен студентами, преподавателями, научными сотрудниками для обучения и стажировок
• Проведение научных исследований и разработка проектов, в том числе в Приполярном Севере
• Организация и проведение международных конференций, семинаров, а также участие специалистов университета в подобных мероприятиях за рубежом
• Совместные публикации научной, методической и учебной литературы
• Создание совместно с зарубежными партнерами культурно-образовательных и учебно-методических центров
• Реализация социальных и творческих проектов, проведение мастер-классов, концертов и художественных выставок.

Развивается академическая мобильность студентов с Университетским колледжем Финнмарка (Норвегия), студенты учатся по программам обмена в Финляндии и Корее.

ИНС поддерживает научные и культурные связи с зарубежными исследовательскими, образовательными и музейными учреждениями, общественными организациями северных стран —  Финляндии, Норвегии, Швеции, Канады, Франции, Японии и др.